|
Малёк
 |
Молекулярная генетика для аквариумистики |
|
Возник такой вопрос. Я работаю в молекулярно-генетической лаборатории, занимаюсь анализом ДНК для всяких разных целей. Недавно реанимировал свое детское увлечение аквариумом. Теперь интересно, можно ли чем-то заниматься на стыке работы и аквариумного хобби. |
|
|
14/07/2011 01:01:16
#1454928 Нравится flax
|
|
Свой на Aqa.ru, Советник
 |
|
Sardanapal ИМХо, кроме определения пола у некоторых видов и определение болезней, остальное маловостребовано. |
|
|
14/07/2011 07:36:46
#1454952 |
|
|
|
Завсегдатай
|
|
|
А мне было бы интересно, относятся ли все Hasemania spp к одному виду или нет, но... Для этого нужно как минимум иметь всех их в наличии. |
|
|
14/07/2011 09:05:18
#1454969 |
|
Премодератор, Советник
|
|
Elohim_Meth Поддерживаю, никто из 8 именитых адресатов-ихтиологов не спешит что-то с ответом по поводу этих рыбок  Sardanapal Вопрос такой, если сравнивать Медную Тетру и Тетру Амстронга ... сколько рыбок нужно, я так понимаю это фатально для самих рыб? 
|
|
|
14/07/2011 17:12:15
#1455143 |
|
Малёк
|
|
|
Вдохновившись Вашим интересом, я обнаружил в сети полезную базу BOLD (Barcode of Life Data Systems). В нее складывают нуклеотидные последовательности некоторых видоспецифичных фрагментов ДНК для всех подряд видов на земле. В базе есть Hasemania nana (http://www.boldsystems.org/views/taxbrowser.php?taxon=Hasemania) Значит можно определить принадлежность к этому виду любого биологического материала. сообщение Button Наука, конечно, требует жертв, но уверен, что можно обойтись без убийств. Для определения видовой принадлежности используют фрагмент митохондриальной ДНК (мтДНК). Это не хромосомная ДНК, которой у нас только по две копии на клетку. мтДНК присутствует в каждой клетке в тысячах копий, поэтому биологического материала в этом случае нужно очень мало. Предполагаю, что в фекалиях рыб достаточно клеток эпителия кишечника, чтобы прошла полимеразная цепная реакция (ПЦР). В этом случае для определения вида понадобится только только некоторое количество фекалий четко известной принадлежности. Наверное это не проблема, если на пару часов отсадить рыбу после кормежки. Но пока это все только теоретически. На практике я хочу сначала проверить на своих лялиусах и жемчужных гурами, работает это или нет. Но даже если не сработает, кусочка плавника ~ 1 мм будет точно достаточно. А для каких видов актуально определение пола? И что может быть востребовано в плане инфекций? Например, распознавание тропического или холодноводного ихтиофтириаза будет интересно? |
|
|
14/07/2011 22:58:57
#1455280 Нравится Button
|
|
Премодератор, Советник
|
|
Sardanapal Спасибо, ждем тогда результатов по имеющимся рыбам, потом Хасеманий. Относительно пола - есть тема по креветкам, когда креветки меняют пол с самца на самку: Повторно хочу поднять вопрос о формировании пола у вишен вообще, по определению пола будет востребовано для креветководов и сомятников (из раздела L сомы). |
|
|
14/07/2011 23:07:09
#1455283 |
|
|
|
Свой на Aqa.ru
|
|
Sardanapal Классно! А , по аквариумным растениям и морским обитателям, такое можно? Изменено 15-7-2011 автор АлександЭр |
|
|
15/07/2011 21:44:54
#1455629 |
|
Свой на Aqa.ru
|
|
сообщение Sardanapal 1. По любому - влиять на дальнейший ход событий мы не в состоянии и см. п. 5. 2. Тоесть - брать анализ рыб только для причесления их к какому либо виду? ... Зачем? Как в своё время мне ответила Мелиса - какая разница породистый у тебя петух или нет - смотри нравится он тебе или нет! и см. п. 5. 3. Выявлять болезни... проще нормальным содержанием их не допускать. и см. п. 5. 4. Интересную рыбу не нерестят в общаге и точно знают родителей. п. 5. - можно не смотреть! ... 5. Возможно владельцу платиновой арованы стоимостью в пол миллиона долларов эти иследования и покажутся интересными, но владелец данек (5руб. за без счёта) врядли будет из Владика Вам кусочек плавника посылать... Утрированно конечно, но анализ стоимость несколько тыр. ИМХО оправдан только для рыб стоимостью несколько десятков тыр. - коих абсолютное меньшинство. |
|
|
16/07/2011 01:33:32
#1455693 |
|
Завсегдатай
|
|
сообщение Sardanapal Может быть, проще взять мазок слизи с поверхности тела рыбы? |
|
|
16/07/2011 11:24:46
#1455738 |
|
|
|
Малёк
|
|
сообщение Button Думаю, результаты пилотного эксперимента смогу представить не раньше чем через неделю. Вчера заказл необходимый реактив - праймеры (синтетические фрагменты ДНК, необходимые для ПЦР-анализа конкретного участка ДНК). Через неделю будут готовы. Если у креветок пол не детерменирован на генетическом уровне, то скорее всего у них нет пол-специфичных ДНК маркеров. Нужно будет что-нибудь почитать на эту тему. |
|
|
16/07/2011 15:00:04
#1455775 Нравится Button
|
|
Малёк
|
|
сообщение АлександЭр Можно для всего живого. Но будет определенная специфика для растений, моллюсков, креветок... С рыбами проще - для них описаны системы анализа универсальные для всех видов. |
|
|
16/07/2011 15:11:53
#1455781 |
|
Малёк
|
|
сообщение OMEGARUS OMEGARUS, спасибо за комментарии. Конечно, нет никакой необходимости генотипировать всех рыб подряд. Но, как Вы видели, есть люди, которым это оказалось интересно, значит идея не такая уж нелепая. Возможно есть селекционеры аквариумных рыб, которым молекулярная генетика могла бы пригодиться. Например, при селекционной работе с сельскохозяйственными животными генетическая паспортизация используется активно (првда, не у нас в стране). Я разместил сообщение в раздел Эксперименты, а не Куплю/Продам, следовательно не планирую на этом зарабатывать деньги. Просто интересно применить методы которые знаю в неосвоенной этими методами области . Но если уж говорить об экономической целесообразности: для человека выявление инфекций методом ПЦР стоит 140-180 руб. Кажется, это меньше, чем цена лекарства из зоомагазина, которое возможно в данном конкретном случае не поможет. |
|
|
16/07/2011 17:50:31
#1455821 |
|
|
|
Малёк
|
|
сообщение Elohim_Meth Хорошая мысль, мазок тоже попробую. |
|
|
16/07/2011 17:51:54
#1455822 |
|
Посетитель
|
|
Sardanapal по-моему, интерес представляет только возможность определения вида у каких-то новых привозных видов или спорных видов (как например ранее у нас путали родостомуса и красноносую тетру). А с учетом того, что сейчас есть возможность заказа рыбы из природных водоемов и наличия у многих видов различных цветовых морф и форм ( что дает вероятность того, что это потенциально могут быть новые виды), то такие иследования могут быть интересны. НО, на мой взгляд это больше интересно ихтиологам-систематикам, простым аквариумистам все-таки это не очень нужно. А так - да. Программа БАР-кодов для морских организмов (в том числе и рыб) идет и довольно быстро. По пресноводным рыбам - не в курсе. Кроме того, лично у меня довольно скептическое отношение к методам генетики. Лично слушал доклад на одной конференции, где использование разных методов (морфология, генетика и некоторые другие) давали не совпадающие результаты. |
|
|
16/07/2011 23:05:42
#1455906 |
|
Малёк
|
|
сообщение kerguduk Но генетику ведь и использут имеенно потому, что она не всегда совпадает с морфологией. Морфология - результат адаптации к условиям среды, а генетика изучает признаки не влияющие на фенотип, что-то вроде молекулярных часов эволюции. Поэтому генетика необходима для построенния естественной систематики и позволяет выявить виды, неразличимые морфологически. С остальным согласен, генетика нужна профессионалам (они и без меня ею прекрасно владеют) и видимо не нужна любителям. Но любопытства ради хочется что-то сделать и на уровне любителя. |
|
|
17/07/2011 22:46:41
#1456208 |
|
|
|
Посетитель
|
|
|
Мне бы было очень интересно насчёт моллинезий , а именно Велиферы, Латипинны, Сфенопсы, Петенензис скрещиваются они или?, и, что у них там с генетикой - насколько они родственны? |
|
|
22/07/2011 10:37:41
#1457919 |
|
Свой на Aqa.ru
|
|
|
Лично мне было бы интересна идентификация гибридных эхинодорусов. |
|
|
22/07/2011 15:28:34
#1458032 |
|
Постоянный посетитель
|
|
|
В таком случае мне была бы интересна возможность определения видовой принадлежности крипт. |
|
|
22/07/2011 15:37:48
#1458037 |
|
|
|
Свой на Aqa.ru
|
|
Sardanapal По растениям очень актуально, т.к. развелось "местных и азиатских лысенковцев/мичуринцев" шлёпают не думая головой. |
|
|
22/07/2011 17:06:29
#1458066 |
|
Посетитель
|
|
Sardanapal Вы , только - когда хоть что то сделаете , получите результат, не вздумайте описывать в открытом доступе. Не хватало нам ещё рыб с птичьими головами или мяукающих гуппи из азии , в поставках получать))) И так уже им слишком много технологий по глупости попало )) |
|
|
22/07/2011 22:28:53
#1458151 |
|
Посетитель
|
|
|
31/07/2011 13:47:21
#1460872 |
|
|
|
На премодерации
|
|
|
Рад что такие изыскания кто-то пытается проводить. Поддерживаю. Будет человек который споры по всяким видовым непоняткам сможет решить. |
|
|
06/09/2011 22:24:38
#1477597 |
что б получилось!
Загружаю
форму....
